Son las colecciones de plantas, insectos o microorganismos, así como su material biológico asociado, tal como tejidos o ADN. La Universidad tiene registradas 53 colecciones de este tipo y las clasificamos en 8 tipos:

Bancos de germoplasma

Sede Palmira, facultad de Ciencias Agropecuarias

Cultivos celulares y genéticos

Sede Bogotá, Instituto de Biotecnología

Sede Bogotá, facultad de Ciencias, departamento de Biología

Sede Bogotá, facultad de Ciencias, departamento de Biología

Sede Bogotá, facultad de Ciencias, departamento de Biología

Sede Medellín, facultad de Ciencias, departamento de Biociencias

Sede Medellín, facultad de Minas, departamento de materiales y minerales - minas

Sede Palmira, facultad de Ciencias Agropecuarias, departamento de Ciencias biológicas

Herbarios

Sede Bogotá, facultad de Ciencias, departamento de Biología 

Sede Bogotá, facultad de Ciencias Agrarias

Sede Amazonía, Instituto de Investigaciones Amazónicas

Sede Palmira, facultad de Ciencias Agropecuarias, departamento de Ciencias biológicas

Sede Caribe, Instituto de Estudios Caribeños

Sede Bogotá, facultad de Ciencias Agrarias, departamento de Agronomía

Sede Medellín, facultad de Ciencias, departamento de Biociencias

Sede Bogotá, facultad de Ciencias, Instituto de Ciencias Naturales

Sede Orinoquía, Instituto de Estudios de la Orinoquía

Sede Medellín, facultad de Ciencias, departamento de Biociencias

Sede Medellín, facultad de Ciencias, departamento de Biociencias

Sede Medellín, facultad de Ciencias, departamento de Ciencias Forestales

Sede Bogotá, facultad de Artes, Escuela de Arquitectura y Urbanismo

Museos

Sede Bogotá, facultad de Ciencias, Instituto de Ciencias Naturales

Tejidos

Sede Bogotá, Instituto de Genética

Sede Medellín, facultad de Ciencias, departamento de Biociencias

Sede Bogotá, facultad de Ciencias, departamento de Biología

Sede Bogotá, facultad de Ciencias, departamento de Biología

Vivas

Sede Palmira, facultad de Ciencias Agropecuarias, departamento de Ciencia animal

Sede Amazonía, Instituto de Investigaciones Amazónicas

Zoológicas

Sede Bogotá, facultad de Ciencias, departamento de Biología

Sede Palmira, facultad de Ciencias Agropecuarias

Sede Bogotá, Instituto de Estudios de la Orinoquía

Sede Palmira, facultad Ciencias Agropecuarias, departamento de Ciencias agrícolas

Sede Bogotá, facultad de Medicina Veterinaria y de Zootecnia, departamento de Salud animal

Sede Amazonía, Instituto de Investigaciones Amazónicas

Bogotá, facultad de Ciencias, Instituto de Ciencias Naturales

Bogotá, facultad de Ciencias, Instituto de Ciencias Naturales

Bogotá, facultad de Ciencias, Instituto de Ciencias Naturales

Bogotá, facultad de Ciencias, Instituto de Ciencias Naturales

Bogotá, facultad de Ciencias, Instituto de Ciencias Naturales

Bogotá, facultad de Ciencias, Instituto de Ciencias Naturales

Bogotá, facultad de Ciencias, Instituto de Ciencias Naturales

Bogotá, facultad de Ciencias, Instituto de Ciencias Naturales

Bogotá, facultad de Ciencias, Instituto de Ciencias Naturales

Bogotá, facultad de Ciencias, Instituto de Ciencias Naturales

Bogotá, facultad de Ciencias, departamento de Biología

Sede Medellín, facultad de Ciencias, departamento de Biociencias

Sede Bogotá, facultad de Ciencias Agrarias, departamento de Agronomía